現行《條例》共六章35條，修改后共六章37條。重點修改了如下內容：

 

　　發揮河湖長制重要作用。明確省、市、縣、鄉、村河湖長組織體系以及各級總河長、河湖長、河長制責任單位的職責，健全河湖長制考核問責機制。全面推行河道警長制，建立健全河道管理聯合執法機制，使河湖長制成為河道管理保護的重要制度保障。

 

　　明確河道管理部門的職責與名稱。取消了省屬流域管理機構的行政職責。

 

　　加強對河道采砂的監管。對“沙石料堆放、轉運、清理、平整”作出更嚴格的規定，進一步加強河道采砂監管力度。

 

　　體現“放管服”改革要求，進一步明確了黃河干流及湟水、大通河、渭河（涇河）和石羊河、疏勒河、討賴河干流河道管理范圍內建設項目洪水影響評價審查權限，刪除了繳納河道采砂管理費的規定。

 

　　甘肅省第十三屆人民代表大會農業與農村委員會還對修訂草案提出修改建議：

 

　　建議對照《中華人民共和國水法》第三十七條、第四十條、第六十五條和《中華人民共和國河道管理條例》第二十四條、第三十五條、第四十四條的規定，在修訂草案中補充完善相關禁止性條款，對“在河道管理范圍內建設妨礙行洪的建筑物、構筑物以及從事影響河勢穩定、危害河岸堤防安全和其他妨礙河道行洪；在河道管理范圍內棄置礦渣、石渣、煤灰、垃圾；在河道內清洗裝貯過油頭或者有毒污染物的車輛、容器；在堤防安全保護區內，進行打井、鉆探、爆破、挖筑魚塘、采石、取土；在江河、湖泊、水庫、渠道內棄置、堆放阻礙行洪的物體和種植阻礙行洪的林木及高稈作物”等危害河道安全的行為作出規范。同時，在第五章法律責任中增設相應罰則。

 

　　建議對照《中華人民共和國水法》第六十五條的規定，在修訂草案第三十條中增加“逾期不拆除的，強行拆除，所需費用由違法單位或者個人負擔”的內容。